มีการระบุว่า ได้มีการปลูกส้มมานานหลายพันปีมาแล้วเชื่อกันว่าส้มหลายชนิด (species) ที่อยู่ในสกุลซิทรัสเป็นพืชที่มีถิ่นกำเนิดหรือเป็นพืชท้องถิ่นดั้งเดิมในเขตร้อนและเขตกึ่งร้อนของทวีปเอเชีย และกลุ่มเกาะมลายู ในประเทศไทยไม่มีหลักฐานปรากฏชัดว่ามีการปลูกส้มกันมาตั้งแต่เมื่อใดพบแต่เพียงรายงานซึ่งมีต้นฉบับเป็นภาษาฝรั่งเศสแปลและจัดพิมพ์เป็นภาษาอังกฤษเมื่อ พ.ศ. ๒๒๓๖ หรือกว่า ๓๐๐ ปีมาแล้ว ที่กล่าวถึงส้มชนิดต่าง ๆ ๓ ชนิด คือ ส้มโอ ส้มแก้ว และมะกรูด สำหรับส้มเขียวหวานนั้นไม่ทราบประวัติที่ชัดเจน มีข้อสันนิษฐานว่าอาจเกิดจากการเพาะเมล็ดและขยายพันธุ์จากส้มแก้วหรือเกิดจากพันธุ์ที่ชาวจีนนำเข้ามาปลูกในภาคกลาง เมื่อประมาณร้อยกว่าปีมาแล้วต่อมาจึงมีการนำไปกระจายปลูกในภาคอื่น ๆ และเรียกกันว่า ส้มเขียวหวาน เพราะเมื่อผลส้มสุกหรือแก่จัดแล้ว ส่วนเปลือกยังคงมีสีเขียวแต่มีรสชาติหวานเป็นลักษณะของส้มทั่วไปที่ปลูกในภาคกลางหรือในพื้นที่ที่อุณหภูมิไม่เย็นจัด